El Metro de Nueva York está pensado para transportar un gran número de personas cada día laborable. Funciona las 24 horas, todos los días del año; solo tres Metros en todo el mundo lo hacen. En 2023 viajaron en el Metro {{formatnum:2027286000}} pasajeros, con una media en días laborables de {{formatnum:6593700}} de usuarios.<ref name="American Public Transportation Association">[{{Cita web |url=https://www.apta.com/wp-content/uploads/2023-Q4-Ridership-APTA.pdf |título=Asociación del Transporte Público de América: "Transit Ridership Report Fourth Quarter 2023" (PDF, en inglés), accedido 2024-04-21] |fechaacceso=21 de abril de 2024 |fechaarchivo=23 de marzo de 2024 |urlarchivo=https://web.archive.org/web/20240323121716/https://www.apta.com/wp-content/uploads/2023-Q4-Ridership-APTA.pdf |deadurl=yes }}</ref> Esta cifra representa un aumento del 13,06% respecto al número de viajeros en 2022, año en el que viajaron un total de {{formatnum:1793073000}} pasajeros. <ref name="Autoridad Metropolitana del Transporte">[https://new.mta.info/agency/new-york-city-transit/subway-bus-ridership-2022 Autoridad Metropolitana del Transporte: Número de viajeros de metro y autobús en 2022 (en inglés), accedido 2024-04-21]</ref> El metro de Nueva York superó los niveles de viajeros que tenía antes de la pandemia de [[COVID-19]]. <ref name="NYU Wagner Graduate School of Public Service">[https://wagner.nyu.edu/news/story/nyu-rudin-looks-nyc-subway-ridership-1975-2015 Wagner Graduate School of Public Service: NYU Rudin analiza el número de usuarios del metro de Nueva York entre 1975 y 2015 (en inglés), accedido 2024-04-21]</ref> <ref name="Metropolitan Transportation Authority">[https://new.mta.info/agency/new-york-city-transit/subway-bus-ridership-2022 Autoridad Metropolitana del Transporte: Número de pasajeros de metro y autobús en 2022 (en inglés), accedido 2024-04-21]</ref> Una estación de metro típica tiene andenes de espera que miden entre 400 y 700 pies (122 a 213 m), suficientes para acomodar un gran número de personas. Los usuarios entran en una estación a través de escaleras en dirección a las taquillas y máquinas de venta para comprar el billete, actualmente con una MetroCard. Después de pasar por el torno, los usuarios bajan a los andenes de espera. Algunas líneas en los distritos exteriores y en el Alto Manhattan tienen vías elevadas con estaciones que los pasajeros tienen que subir. Con algunas excepciones, los túneles del metro entre estaciones tienen una forma rectangular.
La mayoría de líneas y estaciones tienen servicios locales y expresos. Estas últimas tienen tres o cuatro vías -las dos exteriores son para trenes locales y la/las central/es para trenes expresos. Las estaciones donde paran los [[Tren expreso|trenes expresos]] son habitualmente puntos de destino o de transbordo importantes. Una línea (la de [[J/Z (servicio del metro de Nueva York)|Jamaica]], rutas J y Z) usan servicio "''skip-stop''" (alternan paradas) en algunos tramos, en el que dos servicios operan en la línea en horas punta y estaciones menos importantes son servidas por una de las dos rutas en la línea. Desde 1989 y hasta el 31 de mayo de 2005, las rutas 1 y 9 ofrecieron el servicio de paradas alternas en los tramos comprendidos entre las calles 238 y 145, siendo eliminado este servicio por MTA New York City Transit y sustituido por la [[1 (servicio del metro de Nueva York)|ruta 1]] que ahora hace todas las paradas en la línea de Broadway y Séptima Avenida.