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Haplogrupo S (ADN-Y)

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En genética humana, el haplogrupo S es un haplogrupo del ADN del cromosoma Y, característico de Oceanía, por lo que es común tanto en los nativos de Australia como en los de Melanesia y demás islas del Pacífico. Deriva del haplogrupo MS, y como tal está definido por el marcador P405[1]​ y B254. Hasta hace poco S se definió por el marcador M230, pero este queda ahora como un subclado.

S (P405) también es llamado K-P405[2]​ o K2b1a,[3]​ y se habría originado probablemente en Insulindia hace unos 44 mil años.[2]​

Subclados

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Zona de distribución del haplogrupo S-M230 del ADN-Y.

Las frecuencias más importantes son las siguientes:

Rama S-M230

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S1 (M230) es el clado de S más frecuente en Melanesia y el más estudiado. Tiene un origen probable en Nueva Guinea hace 28.000 a 41.000 años.[4]​

Según Kayser et al.2003,[5]​ S (M230) es característico de la región Melanesia y es predominante en la zona montañosa de Papúa Nueva Guinea, con frecuencias del 52%; en las costas de este país encuentra 16%, en las islas Molucas 21%, en los tolái de Nueva Bretaña 12,5% y en islas menores de la Sonda 10%.

Es importante en parte de las islas menores de la Sonda (Indonesia oriental), presentando en Lembata 34%, Sumba 16%, Pantar 15%, Timor 8%, Flores 8% y Alor 7%.[6]​

Frecuencias menores se encuentran en Malaita (Islas Salomón) con 8%[7]​ y poco en Nueva Guinea Occidental, salvo en la zona de lagos Paniai donde se encontró 74%.[8]​ En Vanuatu se encontró 9%, en Célebes 5%, en Nueva Bretaña 4% y en Filipinas 4%.[6]​

S-P60

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Previamente se reportó como K* y con una frecuencia de 42% en aborígenes australianos.[9]​ Según otros datos, en Australia se encontró 30% en Tierra de Arnhem y 17% en Gran Desierto Arenoso.[10]​

Distribución por subclados

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Según la filogenia más reciente (2014),[11]​ los subclados del haplogrupo S son los siguientes:

Haplogrupo S o K2b1a (P405/F3744, B254):

  • S* o K-P405* o K2b1a*: En Micronesia un 6%. En Selangor (Malasia).[12]​
  • S1 (B255)
    • S1*: Encontrado en restos en Australia.[12]​
    • S1a (Z41335, Y26122)
    • S1b (B275): En Filipinas
    • S1c
    • S1d (SK1806): En Papua New Guinea, Indonesia y Vanuatu.
    • K-P315 o K2b1a3: Típico de Melanesia.[13]​
  • S2 (P378) En Filipinas (pueblo aeta)[17]​ con una frecuencia del 60%.[6]​
  • S3 (P336) Poco en Indonesia, particularmente en Alor 26% y Borneo 5.8%.[6]​
  • S4 (BY22870) En Filipinas.


Haplogrupos del cromosoma Y humano

Adán cromosómico
A
BT
B CT
DE CF
D E C F
C1   C2 G H IJK
IJ K
I J LT K2
L T MS P NO
M S Q R N O
R1 R2
R1a R1b


Referencias

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  1. ↑ van Oven M et al 2014.Minimal reference phylogeny for the human Y chromosome. (versión 10-Jun-2014)
  2. ↑ a b YFull Experimental YTree v2.21 1000 Genomes Project © HGDP Project.
  3. ↑ Tatiana M Karafet et al 2014. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia. European Journal of Human Genetics , (4 June 2014) | doi:10.1038/ejhg.2014.106
  4. ↑ a b Laura Scheinfeldt, Françoise Friedlaender, Jonathan Friedlaender, Krista Latham, George Koki, Tatyana Karafet, Michael Hammer and Joseph Lorenz, "Unexpected NRY Chromosome Variation in Northern Island Melanesia," Molecular Biology and Evolution 2006 23(8):1628-1641
  5. ↑ Kayser M, Brauer S, Weiss G, Schiefenho¨vel W, Underhill P, Shen P, Oefner P, Tommaseo-Ponzetta M, Stoneking (2003) Reduced Y-Chromosome, but Not Mitochondrial DNA, Diversity in Human Populations from West New Guinea Am J Hum Genet 72:281–302
  6. ↑ a b c d Karafet, T., Mendez, F., Sudoyo, H. et al. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia. Eur J Hum Genet 23, 369–373 (2015). https://doi.org/10.1038/ejhg.2014.106
  7. ↑ Murray P. Cox y Marta Mirazón Lahr (2006) Y-Chromosome Diversity Is Inversely Associated With Language Affiliation in Paired Austronesian- and Papuan-Speaking Communities from Solomon Islands. American Journal of Human Biology 18:35–50 2006
  8. ↑ a b Stefano Mona et al 2007, Patterns of Y-Chromosome Diversity Intersect with the Trans-New Guinea Hypothesis
  9. ↑ Hammer M et al. 2006 Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes.
  10. ↑ Kayser M et al. 2006, Melanesian and Asian Origins of Polynesians: mtDNA and Y Chromosome Gradients Across the Pacific. Molecular Biology and Evolution 23(11):2234–2244. (2006) doi:10.1093/molbev/msl093
  11. ↑ van Oven M et al 2014. Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome. Hum Mutat 35(2):187-191. doi:10.1002/humu.22468. phylotree
  12. ↑ a b c d S Haplogroup YTree 2012-2020 YFull
  13. ↑ a b Tatiana M Karafet et al 2014. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia. European Journal of Human Genetics. ISSN 1018-4813 EISSN 1476-5438
  14. ↑ Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  15. ↑ Y-DNA Haplogroup K and its Subclades. ISOGG, rev. 2014
  16. ↑ Manfred Kayser, Ying Choi, Mannis van Oven et al., "The impact of the Austronesian expansion: evidence from mtDNA and Y-chromosome diversity in the Admiralty Islands of Melanesia," Molecular Biology and Evolution (2008)
  17. ↑ Y-DNA Haplogroup S and its Subclades - 2019-2020 ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree

Enlaces externos

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