La commune est drainée par la [[Nive des Aldudes]], Ahunztarretako erreka, Behodeyko erreka, un bras Imiliztéguiko erreka, Etchemendiko erreka, Harriondoko erreka, Imiliztéguiko erreka, Labiaringo erreka, Lohitzeko erreka, Soaluzeko erreka, et par divers petits cours d'eau, constituant un réseau hydrographique de {{Unité|30|km}} de longueur totale<ref name="Fiche Siges">{{Lien web |url=http://sigesaqi.brgm.fr/?page=ficheMaCommune&codeCommune=64543|titre= Fiche communale d'Urepel|site =le [http://sigesaqi.brgm.fr/ système d'information pour la gestion des eaux souterraines en région Aquitaine] |consulté le= 11 août 2021}}.</ref>{{,}}<ref group=Carte>{{Géoportail |latitude= 43.0708|longitude= -1.415 |zoom=6 |couches=Carte hydrographique d'Urepel|consulté le=11 août 2021}}.</ref>.
La [[Nive des Aldudes]], d'une longueur totale de {{Unité|35,5|km}}, naît en Navarre au pied du Mendi Haundia (1 232 m), dans la commune d'[[Erro (Navarre)|Erro]] (Espagne), puis s'écoule au nord dans la vallée de Baïgorry pour confluer dans la [[Nive]] à Saint-Martin-d'Arrossa, à 110 m d'altitude à [[Saint-Martin-d'Arrossa]], après avoir traversé {{Unité|6|communes}}<ref>{{sandre|Q91-0400|texte=la Nive des Aldudes}}.</ref>.
