Il club ha attraversato diverse ricostruzioni nel corso degli anni. La squadra femminile originale fu fondata nel 1970 come sezione della polisportiva Hammarby IF. Nel 1999 l'associazione è stata riorganizzata e tutte le sezioni sottostanti sono state separate in un'organizzazione ombrello[3]. Di conseguenza venne fondata l'Hammarby IF DFF, società che integrava nella ragione sociale la sigla finale damfotbollsförening, squadra di calcio femminile. Prima dell'inizio della stagione di Damallsvenskan 2017 l'Hammarby IF DFF si fuse con l'Hammarby Fotboll, che in precedenza includeva la sola sezione maschile.[4][5]
L'Hammarby Fotboll Dam ritiene tuttavia che il loro anno di fondazione sia il 1970, e non 1999 né il 2016.
Durante la sua storia sportiva l'Hammarby ha vinto un titolo di Campione di Svezia al termine della stagione 1985 nel 1985 e due Coppe nazionali nel 1994 e nel 1995.[6], classificandosi inoltre al secondo posto in Damallsvenskan nel 1994 e arrivando alle finali di Svenska Cupen damer nelle prime tre edizioni del torneo (1981, 1982 e 1983).[7]
Le prestazioni della squadra iniziarono a scendere dal 2005, arrivando alla retrocessione in Division 1, l'allora secondo livello del campionato svedese, nel 2011, prima volta nella loro storia sportiva.[8] Prima della sua retrocessione fu una delle sole due squadre (l'altra è l'attuale Rosengård) ad aver giocato tutte le 24 edizioni di Damallsvenskan fino a quella data dalla fondazione della competizione nel 1988.
Negli ultimi anni, l'Hammarby è stato un tipico caso di squadra ascensore. Conclusa la stagione di Elitettan 2014 al secondo posto, dietro al Mallbackens IF, hanno conquistato la promozione giocando la stagione 2015 in Damallsvenskan, tuttavia dopo un primo periodo in cui rimasero nella parte alta della classifica a fine campionato non riuscirono a guadagnare la salvezza. Ancora una volta, al termine della stagione di Elitettan 2016 la squadra con 51 punti raggiunge il secondo posto dietro al Limhamn Bunkeflo guadagnando il diritto di disputare la Damallsvenskan 2017.[9] Al suo ritorno nella massima serie conquista un'agevole salvezza raggiungendo il settimo posto, ma nel campionato 2018 non riesce a uscire dalla parte bassa della classifica e termina all'undicesimo posto con una nuova retrocessione in Elitettan.