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Betacoronavírus

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Os betacoronavírus são um dos quatro gêneros de coronavírus da subfamília Orthocoronavirinae da família Coronaviridae, da ordem Nidovirales . São vírus de RNA de cadeia simples, de sentido positivo, envoltos de origem zoonótica . Os gêneros de coronavírus são compostos de linhagens virais variadas, com o gênero betacoronavírus contendo quatro dessas linhagens. Na literatura mais antiga, esse gênero também é conhecido como conavírus do grupo 2 .

Os Beta-CoVs de maior importância clínica para seres humanos são OC43 e HKU1 da linhagem A, SARS-CoV e 2019-nCov da linhagem B, [1] e MERS-CoV da linhagem C. O MERS-CoV é o primeiro betacoronavírus pertencente à linhagem C que é conhecido por infectar seres humanos. [2] [3]

Os gêneros alfa e beta-coronavírus descendem do pool genético do morcego. [4] [5] [6]

Virologia

Os vírus alfa e betacoronavírus infectam principalmente os morcegos, mas também infectam outras espécies, como seres humanos, camelos e coelhos. [7] [8] [9] [10] Beta-CoVs que causaram epidemias em humanos geralmente induzem febre e sintomas respiratórios. Eles incluem:

Sequência

Os coronavírus têm um grande tamanho de genoma que varia de 26 a 32 kilobases.

Em maio de 2013, o GenBank publicou 46 genomas completos dos CoVs α- (grupo 1), β- (grupo 2), γ- (grupo 3) e δ- (grupo 4). [11]

Classificação

Diagrama da estrutura do virion do coronavírus mostrando picos que formam a "coroa" como a coroa solar, daí o nome.

Dentro do gênero Betacoronavirus (Grupo 2 CoV), quatro linhagens (a, b, ce ed) são comumente reconhecidas.

  • A linhagem A inclui HCoV-OC43 e HCoV-HKU1 (várias espécies)
  • A linhagem B inclui SARS-CoV (várias espécies) e 2019-nCoV
  • A linhagem C inclui coronavírus de morcego Tylonycteris HKU4 (BtCoV-HKU4), coronavírus de morcego Pipistrellus HKU5 (BtCoV-HKU5) e MERS-CoV (várias espécies)
  • A linhagem D inclui o coronavírus de morcego Rousettus HKU9 (BtCoV-HKU9) [12]

As quatro linhagens também são nomeadas usando letras gregas ou numericamente. [13]

Morfologia

Os vírus da linhagem A diferem de todos os outros do gênero, pois possuem uma proteína mais curta, chamada hemaglutinina esterase (HE) .

O nome Coronavírus é derivado do latim "corona", que significa coroa ou halo, referindo-se à sua imagem sob microscopia eletrônica de espigões semelhantes a coroas em sua superfície semelhante à coroa solar . Essa morfologia é criada pelos peplômeros do pico viral (S), que são proteínas que povoam a superfície do vírus e determinam o tropismo do hospedeiro . A ordem Nidovirales é nomeada para o latín nidus, que significa ninho. Refere-se à produção desta ordem de um conjunto aninhado co-terminal 3 'de mRNAs subgenômicos durante a infecção. [14]

Várias estruturas das proteínas spike foram resolvidas. O domínio de ligação ao receptor na proteína de pico de alfa e beta-coronavírus é classificado como InterPro . [15] Os monta proteína espigão num trímero ( PDB 3jcl ); sua estrutura principal se assemelha à das proteínas paramixovírus F (fusão). [16]

Referências

  1. ↑ «Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses». nextstrain 
  2. ↑ ProMED. MERS-CoV–Eastern Mediterranean (06) (http://www.promedmail.org/)
  3. ↑ «Family Cluster of Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus Infections». New England Journal of Medicine. 368: 2487–94. 2013. PMID 23718156. doi:10.1056/NEJMoa1303729 
  4. ↑ «Comparative analysis of twelve genomes of three novel group 2c and group 2d coronaviruses reveals unique group and subgroup features». Journal of Virology. 81: 1574–85. 2007. PMC 1797546Acessível livremente. PMID 17121802. doi:10.1128/JVI.02182-06 
  5. ↑ «Isolation and characterization of a novel Betacoronavirus subgroup A coronavirus, rabbit coronavirus HKU14, from domestic rabbits». Journal of Virology. 86: 5481–96. 2012. PMC 3347282Acessível livremente. PMID 22398294. doi:10.1128/JVI.06927-11 
  6. ↑ «Coexistence of different genotypes in the same bat and serological characterization of Rousettus bat coronavirus HKU9 belonging to a novel Betacoronavirus subgroup». Journal of Virology. 84: 11385–94. 2010. PMC 2953156Acessível livremente. PMID 20702646. doi:10.1128/JVI.01121-10 
  7. ↑ «Comparative analysis of twelve genomes of three novel group 2c and group 2d coronaviruses reveals unique group and subgroup features». Journal of Virology. 81: 1574–85. 2007. PMC 1797546Acessível livremente. PMID 17121802. doi:10.1128/JVI.02182-06 
  8. ↑ «Isolation and characterization of a novel Betacoronavirus subgroup A coronavirus, rabbit coronavirus HKU14, from domestic rabbits». Journal of Virology. 86: 5481–96. 2012. PMC 3347282Acessível livremente. PMID 22398294. doi:10.1128/JVI.06927-11 
  9. ↑ «Coexistence of different genotypes in the same bat and serological characterization of Rousettus bat coronavirus HKU9 belonging to a novel Betacoronavirus subgroup». Journal of Virology. 84: 11385–94. 2010. PMC 2953156Acessível livremente. PMID 20702646. doi:10.1128/JVI.01121-10 
  10. ↑ «Serological evidence of MERS-CoV and HKU8-related CoV co-infection in Kenyan camels». Emerging Microbes & Infections. 8: 1528–1534. doi:10.1080/22221751.2019.1679610 
  11. ↑ «Full-Genome Deep Sequencing and Phylogenetic Analysis of Novel Human Betacoronavirus - Vol. 19 No. 5 - May 2013 - CDC». Emerging Infectious Diseases. 19: 736–42B. PMC 3647518Acessível livremente. PMID 23693015. doi:10.3201/eid1905.130057 
  12. ↑ «ECDC Rapid Risk Assessment - Severe respiratory disease associated with a novel coronavirus» (PDF) 
  13. ↑ «Full-Genome Deep Sequencing and Phylogenetic Analysis of Novel Human Betacoronavirus - Vol. 19 No. 5 - May 2013 - CDC». Emerging Infectious Diseases. 19: 736–42B. PMC 3647518Acessível livremente. PMID 23693015. doi:10.3201/eid1905.130057 
  14. ↑ «Coronavirus genomics and bioinformatics analysis». Viruses. 2: 1804–20. 2010. PMC 3185738Acessível livremente. PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803 
  15. ↑ «Putative Receptor Binding Domain of Bat-Derived Coronavirus HKU9 Spike Protein: Evolution of Betacoronavirus Receptor Binding Motifs.». Biochemistry. 55: 5977-5988. PMID 27696819. doi:10.1021/acs.biochem.6b00790 
  16. ↑ «Cryo-electron microscopy structure of a coronavirus spike glycoprotein trimer». Nature. 531: 114–117. doi:10.1038/nature16988 
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