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Betacoronavírus

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Os betacoronavírus são um dos quatro gêneros de coronavírus da subfamília Orthocoronavirinae da família Coronaviridae, da ordem Nidovirales. São vírus de RNA de cadeia simples, de sentido positivo, envoltos de origem zoonótica. Os gêneros de coronavírus são compostos de linhagens virais variadas, com o gênero betacoronavírus contendo quatro dessas linhagens. Na literatura mais antiga, esse gênero também é conhecido como coronavírus do grupo 2 .

Os Beta-CoVs de maior importância clínica para seres humanos são OC43 e HKU1 da linhagem A, SARS-CoV e SARS-CoV-2 da linhagem B, [1] e MERS-CoV da linhagem C. O MERS-CoV é o primeiro betacoronavírus pertencente à linhagem C que é conhecido por infectar seres humanos.[2][3]

Os gêneros alfa e beta-coronavírus descendem do fundo genético do morcego. [4][5][6]

Virologia

Os vírus alfa e betacoronavírus infectam principalmente os morcegos, mas também infectam outras espécies, como seres humanos, camelos e coelhos. [7] [8] [9] [10] Beta-CoVs que causaram epidemias em humanos geralmente induzem febre e sintomas respiratórios. Eles incluem:

Sequência

Os coronavírus têm um grande tamanho de genoma que varia de 26 a 32 kilobases.

Em maio de 2013, o GenBank publicou 46 genomas completos dos CoVs α- (grupo 1), β- (grupo 2), γ- (grupo 3) e δ- (grupo 4). [11]

Classificação

Diagrama da estrutura do virion do coronavírus mostrando picos que formam a "coroa" como a coroa solar, daí o nome.

Dentro do gênero Betacoronavirus (Grupo 2 CoV), quatro linhagens (a, b, ce ed) são comumente reconhecidas.

  • A linhagem A inclui HCoV-OC43 e HCoV-HKU1 (várias espécies)
  • A linhagem B inclui SARS-CoV (várias espécies) e 2019-nCoV
  • A linhagem C inclui coronavírus de morcego Tylonycteris HKU4 (BtCoV-HKU4), coronavírus de morcego Pipistrellus HKU5 (BtCoV-HKU5) e MERS-CoV (várias espécies)
  • A linhagem D inclui o coronavírus de morcego Rousettus HKU9 (BtCoV-HKU9) [12]

As quatro linhagens também são nomeadas usando letras gregas ou numericamente. [13]

Morfologia

Os vírus da linhagem A diferem de todos os outros do gênero, pois possuem uma proteína mais curta, chamada hemaglutinina esterase (HE) .

O nome Coronavírus é derivado do latim "corona", que significa coroa ou halo, referindo-se à sua imagem sob microscopia eletrônica de espigões semelhantes a coroas em sua superfície semelhante à coroa solar . Essa morfologia é criada pelos peplômeros do pico viral (S), que são proteínas que povoam a superfície do vírus e determinam o tropismo do hospedeiro . A ordem Nidovirales é nomeada para o latín nidus, que significa ninho. Refere-se à produção desta ordem de um conjunto aninhado co-terminal 3 'de mRNAs subgenômicos durante a infecção. [14]

Várias estruturas das proteínas spike foram resolvidas. O domínio de ligação ao receptor na proteína de pico de alfa e beta-coronavírus é classificado como InterPro.[15] Os monta proteína espigão num trímero ( PDB 3jcl ); sua estrutura principal se assemelha à das proteínas paramixovírus F (fusão).[16]

Referências

  1. ↑ «Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses». nextstrain 
  2. ↑ ProMED. MERS-CoV–Eastern Mediterranean (06) (http://www.promedmail.org/)
  3. ↑ «Family Cluster of Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus Infections». New England Journal of Medicine. 368: 2487–94. 2013. PMID 23718156. doi:10.1056/NEJMoa1303729 
  4. ↑ «Comparative analysis of twelve genomes of three novel group 2c and group 2d coronaviruses reveals unique group and subgroup features». Journal of Virology. 81: 1574–85. 2007. PMC 1797546Acessível livremente. PMID 17121802. doi:10.1128/JVI.02182-06 
  5. ↑ «Isolation and characterization of a novel Betacoronavirus subgroup A coronavirus, rabbit coronavirus HKU14, from domestic rabbits». Journal of Virology. 86: 5481–96. 2012. PMC 3347282Acessível livremente. PMID 22398294. doi:10.1128/JVI.06927-11 
  6. ↑ «Coexistence of different genotypes in the same bat and serological characterization of Rousettus bat coronavirus HKU9 belonging to a novel Betacoronavirus subgroup». Journal of Virology. 84: 11385–94. 2010. PMC 2953156Acessível livremente. PMID 20702646. doi:10.1128/JVI.01121-10 
  7. ↑ «Comparative analysis of twelve genomes of three novel group 2c and group 2d coronaviruses reveals unique group and subgroup features». Journal of Virology. 81: 1574–85. 2007. PMC 1797546Acessível livremente. PMID 17121802. doi:10.1128/JVI.02182-06 
  8. ↑ «Isolation and characterization of a novel Betacoronavirus subgroup A coronavirus, rabbit coronavirus HKU14, from domestic rabbits». Journal of Virology. 86: 5481–96. 2012. PMC 3347282Acessível livremente. PMID 22398294. doi:10.1128/JVI.06927-11 
  9. ↑ «Coexistence of different genotypes in the same bat and serological characterization of Rousettus bat coronavirus HKU9 belonging to a novel Betacoronavirus subgroup». Journal of Virology. 84: 11385–94. 2010. PMC 2953156Acessível livremente. PMID 20702646. doi:10.1128/JVI.01121-10 
  10. ↑ «Serological evidence of MERS-CoV and HKU8-related CoV co-infection in Kenyan camels». Emerging Microbes & Infections. 8: 1528–1534. doi:10.1080/22221751.2019.1679610 
  11. ↑ «Full-Genome Deep Sequencing and Phylogenetic Analysis of Novel Human Betacoronavirus - Vol. 19 No. 5 - May 2013 - CDC». Emerging Infectious Diseases. 19: 736–42B. PMC 3647518Acessível livremente. PMID 23693015. doi:10.3201/eid1905.130057 
  12. ↑ «ECDC Rapid Risk Assessment - Severe respiratory disease associated with a novel coronavirus» (PDF) 
  13. ↑ «Full-Genome Deep Sequencing and Phylogenetic Analysis of Novel Human Betacoronavirus - Vol. 19 No. 5 - May 2013 - CDC». Emerging Infectious Diseases. 19: 736–42B. PMC 3647518Acessível livremente. PMID 23693015. doi:10.3201/eid1905.130057 
  14. ↑ «Coronavirus genomics and bioinformatics analysis». Viruses. 2: 1804–20. 2010. PMC 3185738Acessível livremente. PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803 
  15. ↑ «Putative Receptor Binding Domain of Bat-Derived Coronavirus HKU9 Spike Protein: Evolution of Betacoronavirus Receptor Binding Motifs.». Biochemistry. 55: 5977-5988. PMID 27696819. doi:10.1021/acs.biochem.6b00790 
  16. ↑ «Cryo-electron microscopy structure of a coronavirus spike glycoprotein trimer». Nature. 531: 114–117. doi:10.1038/nature16988 

Ligações externas

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