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Ficheiro:Nitrogenase general catalytic scheme.svg

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Descrição
English: A general catalytic mechanism scheme for nitrogenase. A) Components I and II are dissociated; II is ready for reduction. B) ATP binds to component II, which receives electrons from an electron donor (ferredoxin or flavodoxin); binding of ATP induces an allosteric conformational change which allows association of the two proteins. Electrons flow from the [4Fe-4S] cluster on II to the P cluster on I. C) Electrons are further shuttled to the iron-molybdenum cofactor (FeMoco), and ATP is hydrolised to ADP. This step is repeated several times before a molecule of N2 can bind to FeMoco. D) The protein complex dissociates, and nitrogenase reduces dinitrogen to ammonia and dihydrogen. I: component I (dinitrogenase; MoFe protein); II: component II (dinitrogen reductase; Fe protein); ATP: adenosine triphosphate; ADP: adenosine diphosphate; Fdx: ferredoxin; Fld: flavodoxin.

The precise order of some of these steps is not totally understood, and therefore this scheme should not be seen as an established mechanism.

[4Fe-4S] cluster was traced from PDB file 2NIP; P cluster and FeMoco were traced from PDB file 1M1N.

Sources:

  • Seefeldt, L.C.; Hoffman, B.M., Dean, D.R. (2009). "Mechanism of Mo-Dependent Nitrogenase", Annu Rev Biochem 78: 701-22. DOI:10.1146/annurev.biochem.78.070907.103812
  • Burgess, B.K.; Lowe, D.J. (1996). "Mechanism of Molybdenum Nitrogenase", Chem. Rev. 96: 2983–3012. ACS Publications. DOI:10.1021/cr950055x
  • Barney, B.M.; Lee, H.-I., dos Santos, P.C., Hoffman, B.M., Dean, D.R., Seefeldt, L.C. (2006). "Breaking the N2 triple bond: insights into the nitrogenase mechanism", Dalton Trans. 19: 2277-84. RSC Publishing. DOI:10.1039/B517633F
Português: Esquema geral do mecanismo catalítico da nitrogenase. A) As componentes I e II encontram-se dissociadas; II está pronta para ser reduzida. B) O ATP liga-se à componente II, que por sua vez recebe electrões de um dador electrónico; a ligação do ATP induz uma mudança conformacional alostérica que permite a associação das duas proteínas. Ocorre transferência de electrões do centro [4Fe-4S] de II para o centro P de I. C) Os electrões são transportados para o centro FeMo e o ATP é hidrolisado a ADP. Este passo ocorre diversas vezes antes da ligação de um N2 ao centro FeMo. D) O complexo proteico dissocia-se e a nitrogenase reduz o N2 a NH3 e H2. I: componente I; II: componente II; Fdx: ferredoxina; Fld: flavodoxina.

A ordem exacta de alguns destes passos não é totalmente conhecida e por isso este esquema não deve ser encarado como um mecanismo estabelecido.

O centro [4Fe-4S] foi desenhado a partir do ficheiro PDB 2NIP; os centro FeMo e P foram desenhados a partir do ficheiro PDB 1M1N.

Fontes:

  • Seefeldt, L.C.; Hoffman, B.M., Dean, D.R. (2009). "Mechanism of Mo-Dependent Nitrogenase", Annu Rev Biochem 78: 701-22. DOI:10.1146/annurev.biochem.78.070907.103812
  • Burgess, B.K.; Lowe, D.J. (1996). "Mechanism of Molybdenum Nitrogenase", Chem. Rev. 96: 2983–3012. ACS Publications. DOI:10.1021/cr950055x
  • Barney, B.M.; Lee, H.-I., dos Santos, P.C., Hoffman, B.M., Dean, D.R., Seefeldt, L.C. (2006). "Breaking the N2 triple bond: insights into the nitrogenase mechanism", Dalton Trans. 19: 2277-84. RSC Publishing. DOI:10.1039/B517633F
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Autor PatríciaR
 
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17h37min de 18 de setembro de 2011Miniatura da versão das 17h37min de 18 de setembro de 2011624 × 355 (1 019 kB)PatríciaRTrying to fix font problem by having it converted to paths.
17h31min de 18 de setembro de 2011Miniatura da versão das 17h31min de 18 de setembro de 2011624 × 355 (983 kB)PatríciaRTrying to fix "black box syndrome"
17h28min de 18 de setembro de 2011Miniatura da versão das 17h28min de 18 de setembro de 2011624 × 355 (991 kB)PatríciaR{{Information |Description ={{en|1=A general catalytic mechanism scheme for nitrogenase. A) Components I and II are dissociated; II is ready for reduction. B) ATP binds to component II, which receives electrons from an electron donor (ferredoxin or fla

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