SIP1: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Интерактивная навигация по истории
[отпатрулированная версия][отпатрулированная версия]
← Предыдущая правка
Содержимое удалено Содержимое добавлено
ВизуальныйВики-текст
обновление
 
(не показаны 4 промежуточные версии 4 участников)
Строка 1: Строка 1:
{{Ген}}
{{GNF_Protein_box
⚫
'''Белок связанный с белком выживания моторных нейронов 1''' ({{lang-en|Survival of motor neuron protein-interacting protein 1}}) — [[белок]], который у людей кодируется [[ген]]ом ''SIP1''<ref name="pmid9323130">{{статья |заглавие=The SMN-SIP1 complex has an essential role in spliceosomal snRNP biogenesis |издание=[[Cell (журнал)|Cell]] |том=90 |номер=6 |страницы=1023—1029 |pmid=9323130 |doi=10.1016/S0092-8674(00)80368-2 |язык=en |тип=journal |автор=Fischer U., Liu Q., Dreyfuss G. |месяц=10 |год=1997 |издательство=[[Cell Press]] }}</ref><ref name="pmid9323129">{{статья |заглавие=The spinal muscular atrophy disease gene product, SMN, and its associated protein SIP1 are in a complex with spliceosomal snRNP proteins |издание=[[Cell (журнал)|Cell]] |том=90 |номер=6 |страницы=1013—1021 |pmid=9323129 |doi=10.1016/S0092-8674(00)80367-0 |язык=en |тип=journal |автор=Liu Q., Fischer U., Wang F., Dreyfuss G. |месяц=10 |год=1997 |издательство=[[Cell Press]] }}</ref><ref name="entrez">{{cite web | title = Entrez Gene: SIP1 survival of motor neuron protein interacting protein 1| url = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=8487| accessdate = }}</ref>.
| Name = SIP1
| image =
| image_source =
| PDB = {{PDB2|2LEH}}, {{PDB2|3S6N}}
| HGNCid = 10884
| MGIid = 1913853
| Symbol = GEMIN2
| AltSymbols =; SIP1; SIP1-delta
| IUPHAR =
| ChEMBL =
| OMIM = 602595
| ECnumber =
| Homologene = 37827
| GeneAtlas_image1 = PBB_GE_SIP1_205063_at_tn.png
| GeneAtlas_image2 = PBB_GE_SIP1_210779_x_at_tn.png
| GeneAtlas_image3 = PBB_GE_SIP1_211114_x_at_tn.png
| Protein_domain_image =
| Function = {{GNF_GO|id=GO:0005515 |text = protein binding}}
| Component = {{GNF_GO|id=GO:0005634 |text = nucleus}} {{GNF_GO|id=GO:0005654 |text = nucleoplasm}} {{GNF_GO|id=GO:0005681 |text = spliceosomal complex}} {{GNF_GO|id=GO:0005730 |text = nucleolus}} {{GNF_GO|id=GO:0005737 |text = cytoplasm}} {{GNF_GO|id=GO:0005829 |text = cytosol}} {{GNF_GO|id=GO:0032797 |text = SMN complex}} {{GNF_GO|id=GO:0034719 |text = SMN-Sm protein complex}} {{GNF_GO|id=GO:0097504 |text = Gemini of coiled bodies}}
| Process = {{GNF_GO|id=GO:0000245 |text = spliceosomal complex assembly}} {{GNF_GO|id=GO:0000375 |text = RNA splicing, via transesterification reactions}} {{GNF_GO|id=GO:0000387 |text = spliceosomal snRNP assembly}} {{GNF_GO|id=GO:0006397 |text = mRNA processing}} {{GNF_GO|id=GO:0008380 |text = RNA splicing}} {{GNF_GO|id=GO:0010467 |text = gene expression}} {{GNF_GO|id=GO:0034660 |text = ncRNA metabolic process}}
| Hs_EntrezGene = 8487
| Hs_Ensembl = ENSG00000092208
| Hs_RefseqmRNA = NM_001009182
| Hs_RefseqProtein = NP_001009182
| Hs_GenLoc_db = hg38
| Hs_GenLoc_chr = 14
| Hs_GenLoc_start = 39114223
| Hs_GenLoc_end = 39136973
| Hs_Uniprot = O14893
| Mm_EntrezGene = 66603
| Mm_Ensembl = ENSMUSG00000060121
| Mm_RefseqmRNA = NM_025656
| Mm_RefseqProtein = NP_079932
| Mm_GenLoc_db = mm10
| Mm_GenLoc_chr = 12
| Mm_GenLoc_start = 59013393
| Mm_GenLoc_end = 59028470
| Mm_Uniprot = Q9CQQ4
| path = PBB/8487
}}
⚫
'''Белок связанный с белком выживания моторных нейронов 1''' ({{lang-en|Survival of motor neuron protein-interacting protein 1}}) — это [[белок]], который у людей кодируется [[ген]]ом ''SIP1''<ref name="pmid9323130">{{cite journal | author = Fischer U, Liu Q, Dreyfuss G | title = The SMN-SIP1 complex has an essential role in spliceosomal snRNP biogenesis | journal = Cell | volume = 90 | issue = 6 | pages = 1023–9 |date=October 1997 | pmid = 9323130 | pmc = | doi =10.1016/S0092-8674(00)80368-2 }}</ref><ref name="pmid9323129">{{cite journal | author = Liu Q, Fischer U, Wang F, Dreyfuss G | title = The spinal muscular atrophy disease gene product, SMN, and its associated protein SIP1 are in a complex with spliceosomal snRNP proteins | journal = Cell | volume = 90 | issue = 6 | pages = 1013–21 |date=October 1997 | pmid = 9323129 | pmc = | doi =10.1016/S0092-8674(00)80367-0 }}</ref><ref name="entrez">{{cite web | title = Entrez Gene: SIP1 survival of motor neuron protein interacting protein 1| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=8487| accessdate = }}</ref>.


== Взаимодействия ==
== Взаимодействия ==
Как было показано белок SIP1 [[Белок-белковые взаимодействия|взаимодействует]] с [[DDX20]]<ref name=pmid11914277>{{cite journal |last=Mourelatos |first=Zissimos |authorlink= |author2=Dostie Josée |author3=Paushkin Sergey |author4=Sharma Anup |author5=Charroux Bernard |author6=Abel Linda |author7=Rappsilber Juri |author8=Mann Matthias |author9=Dreyfuss Gideon |date=March 2002 |title=miRNPs: a novel class of ribonucleoproteins containing numerous microRNAs |journal=Genes Dev. |volume=16 |issue=6 |pages=720–8 |publisher= |location = United States| issn = 0890-9369| pmid = 11914277 |doi = 10.1101/gad.974702 | bibcode = | oclc =| id = | url = | language = | format = | accessdate = | laysummary = | laysource = | laydate = | quote = |pmc=155365 }}</ref><ref name=pmid10601333>{{cite journal |author=Charroux B Pellizzoni L Perkinson R A Shevchenko A Mann M Dreyfuss G |date=December 1999 |title=Gemin3: A Novel Dead Box Protein That Interacts with Smn, the Spinal Muscular Atrophy Gene Product, and Is a Component of Gems |journal=J. Cell Biol. |volume=147 |issue=6 |pages=1181–94 |publisher= |location = UNITED STATES| issn = 0021-9525| pmid = 10601333 |doi=10.1083/jcb.147.6.1181 |pmc=2168095 }}</ref> и [[SMN1]]<ref name=pmid9323129/><ref name=pmid12668731>{{cite journal|author= Carnegie Graeme K Sleeman Judith E Morrice Nick Hastie C James Peggie Mark W Philp Amanda Lamond Angus I Cohen Patricia T W |date=May 2003 |title=Protein phosphatase 4 interacts with the Survival of motor neurons complex and enhances the temporal localisation of snRNPs |journal=J. Cell. Sci. |volume=116 |issue=Pt 10 |pages=1905–13 |publisher= |location = England| issn = 0021-9533| pmid = 12668731 |doi = 10.1242/jcs.00409}}</ref><ref name=pmid10942426>{{cite journal |last=Meister |first=G |author= Bühler D Laggerbauer B Zobawa M Lottspeich F Fischer U |date=August 2000 |title=Characterization of a nuclear 20S complex containing the survival of motor neurons (SMN) protein and a specific subset of spliceosomal Sm proteins |journal=Hum. Mol. Genet. |volume=9 |issue=13 |pages=1977–86 |publisher= |location = ENGLAND| issn = 0964-6906| pmid = 10942426 | bibcode = | oclc =| id = | url = | language = | format = | accessdate = | laysummary = | laysource = | laydate = | quote = |doi=10.1093/hmg/9.13.1977 }}</ref>.
Как было показано белок SIP1 [[Белок-белковые взаимодействия|взаимодействует]] с [[DDX20]]<ref name=pmid11914277>{{статья |заглавие=miRNPs: a novel class of ribonucleoproteins containing numerous microRNAs |издание=[[Genes & Development|Genes Dev.]] |том=16 |номер=6 |страницы=720—728 |место=United States |issn=0890-9369 |pmid=11914277 |doi=10.1101/gad.974702 |pmc=155365 |язык=en |тип=journal |автор=Mourelatos, Zissimos; Dostie Josée; Paushkin Sergey; Sharma Anup; Charroux Bernard; Abel Linda; Rappsilber Juri; Mann Matthias; Dreyfuss Gideon |месяц=3 |год=2002}}</ref><ref name=pmid10601333>{{статья |заглавие=Gemin3: A Novel Dead Box Protein That Interacts with Smn, the Spinal Muscular Atrophy Gene Product, and Is a Component of Gems |издание={{Нп3|Journal of Cell Biology|J. Cell Biol.||Journal of Cell Biology}} |том=147 |номер=6 |страницы=1181—1194 |место=UNITED STATES |issn=0021-9525 |pmid=10601333 |doi=10.1083/jcb.147.6.1181 |pmc=2168095 |язык=en |тип=journal |автор=Charroux B Pellizzoni L Perkinson R A Shevchenko A Mann M Dreyfuss G. |месяц=12 |год=1999}}</ref> и [[SMN1]]<ref name=pmid9323129/><ref name=pmid12668731>{{статья |заглавие=Protein phosphatase 4 interacts with the Survival of motor neurons complex and enhances the temporal localisation of snRNPs |издание={{Нп3|Journal of Cell Science}} |том=116 |номер=Pt 10 |страницы=1905—1913 |место=England |issn=0021-9533 |pmid=12668731 |doi=10.1242/jcs.00409 |язык=en |тип=journal |автор=Carnegie Graeme K Sleeman Judith E Morrice Nick Hastie C James Peggie Mark W Philp Amanda Lamond Angus I Cohen Patricia T W. |месяц=5 |год=2003 |издательство={{Нп3|The Company of Biologists}} }}</ref><ref name=pmid10942426>{{статья |заглавие=Characterization of a nuclear 20S complex containing the survival of motor neurons (SMN) protein and a specific subset of spliceosomal Sm proteins |издание={{Нп3|Human Molecular Genetics}} |том=9 |номер=13 |страницы=1977—1986 |место=ENGLAND |issn=0964-6906 |pmid=10942426 |doi=10.1093/hmg/9.13.1977 |язык=en |тип=journal |автор=Meister, G; Bühler D Laggerbauer B Zobawa M Lottspeich F Fischer U. |месяц=8 |год=2000 |издательство=[[Oxford University Press]] }}</ref>.


== См. также ==
== См. также ==
Строка 52: Строка 12:
{{примечания}}
{{примечания}}
{{Клеточное ядро}}
{{Клеточное ядро}}
[[Категория:Гены 14-й хромосомы]]

Текущая версия от 17:19, 10 января 2023

SIP1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2LEH, 3S6N

Идентификаторы
ПсевдонимыGEMIN2, SIP1, SIP1-delta, Survival of motor neuron protein-interacting protein 1, gem nuclear organelle associated protein 2
Внешние IDOMIM: 602595 MGI: 1913853 HomoloGene: 37827 GeneCards: GEMIN2
Расположение гена (человек)
14-я хромосома человека
Хр.14-я хромосома человека[1]
14-я хромосома человека
Расположение в геноме GEMIN2
Расположение в геноме GEMIN2
Локус14q21.1Начало39,114,285 bp[1]
Конец39,136,973 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
12-я хромосома мыши
Хр.12-я хромосома мыши[2]
12-я хромосома мыши
Расположение в геноме GEMIN2
Расположение в геноме GEMIN2
Локус12|12 C1Начало59,060,179 bp[2]
Конец59,075,256 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • buccal mucosa cell

  • secondary oocyte

  • ventricular zone

  • right testis

  • left testis
Наибольшая экспрессия в
  • otic placode

  • endocardial cushion

  • primitive streak

  • otic vesicle
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

8487

66603

Ensembl

ENSG00000092208

ENSMUSG00000060121

UniProt

O14893

Q9CQQ4

RefSeq (мРНК)

NM_001009182
NM_001009183
NM_003616

NM_025656

RefSeq (белок)

NP_001009182
NP_001009183
NP_003607

NP_079932

Локус (UCSC)Chr 14: 39.11 – 39.14 MbChr 12: 59.06 – 59.08 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Белок связанный с белком выживания моторных нейронов 1 (англ. Survival of motor neuron protein-interacting protein 1) — белок, который у людей кодируется геном SIP1[5][6][7].

Взаимодействия

[править | править код]

Как было показано белок SIP1 взаимодействует с DDX20[8][9] и SMN1[6][10][11].

См. также

[править | править код]

Примечания

[править | править код]
  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000092208 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000060121 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Fischer U., Liu Q., Dreyfuss G. The SMN-SIP1 complex has an essential role in spliceosomal snRNP biogenesis (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — October (vol. 90, no. 6). — P. 1023—1029. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80368-2. — PMID 9323130.
  6. ↑ 1 2 Liu Q., Fischer U., Wang F., Dreyfuss G. The spinal muscular atrophy disease gene product, SMN, and its associated protein SIP1 are in a complex with spliceosomal snRNP proteins (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — October (vol. 90, no. 6). — P. 1013—1021. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80367-0. — PMID 9323129.
  7. ↑ Entrez Gene: SIP1 survival of motor neuron protein interacting protein 1.
  8. ↑ Mourelatos, Zissimos; Dostie Josée; Paushkin Sergey; Sharma Anup; Charroux Bernard; Abel Linda; Rappsilber Juri; Mann Matthias; Dreyfuss Gideon. miRNPs: a novel class of ribonucleoproteins containing numerous microRNAs (англ.) // Genes Dev. : journal. — United States, 2002. — March (vol. 16, no. 6). — P. 720—728. — ISSN 0890-9369. — doi:10.1101/gad.974702. — PMID 11914277. — PMC 155365.
  9. ↑ Charroux B Pellizzoni L Perkinson R A Shevchenko A Mann M Dreyfuss G. Gemin3: A Novel Dead Box Protein That Interacts with Smn, the Spinal Muscular Atrophy Gene Product, and Is a Component of Gems (англ.) // J. Cell Biol.[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1999. — December (vol. 147, no. 6). — P. 1181—1194. — ISSN 0021-9525. — doi:10.1083/jcb.147.6.1181. — PMID 10601333. — PMC 2168095.
  10. ↑ Carnegie Graeme K Sleeman Judith E Morrice Nick Hastie C James Peggie Mark W Philp Amanda Lamond Angus I Cohen Patricia T W. Protein phosphatase 4 interacts with the Survival of motor neurons complex and enhances the temporal localisation of snRNPs (англ.) // Journal of Cell Science[англ.] : journal. — England: The Company of Biologists[англ.], 2003. — May (vol. 116, no. Pt 10). — P. 1905—1913. — ISSN 0021-9533. — doi:10.1242/jcs.00409. — PMID 12668731.
  11. ↑ Meister, G; Bühler D Laggerbauer B Zobawa M Lottspeich F Fischer U. Characterization of a nuclear 20S complex containing the survival of motor neurons (SMN) protein and a specific subset of spliceosomal Sm proteins (англ.) // Human Molecular Genetics[англ.] : journal. — ENGLAND: Oxford University Press, 2000. — August (vol. 9, no. 13). — P. 1977—1986. — ISSN 0964-6906. — doi:10.1093/hmg/9.13.1977. — PMID 10942426.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=SIP1&oldid=127793551