Izvorni kod stranice Proteinske metode

'''Protein metode''' su tehnike koje se koriste za studiranje [[protein]]a.

Postoji niz eksperimentalnih metoda za studiranje proteina, npr. za detektovanje proteina, za izolovanje i prečišćavanje proteina i druge metode za karakterisanje strukture i funkcije proteina. Za primenu ovih metoda često je neophodno da se prvo prečisti protein. ''Računarske'' metode tipično koriste kompjuterske programe za analizu proteina. Mnoge eksperimentalne metode koriste kompjutersku analizu obradu sirovih podataka (npr. [[masena spektrometrija]]).

{{columns-list|<nowiki/>
== Genetičke metode ==
Eksperimentalna analiza proteina tipično počinje [[Ekspresija gena|izražavanjem]] i prečišćavanjem proteina. Izražavanje se ostvaruje manipulusanjem [[DNK]] koja kodira protein(e) od interesa. Iz tog razloga za proteinska analizu su obično neophodne DNK metode, posebno [[kloniranje]]. Drugi primeri su

* konceptualna translacija - mnogi proteini nikad nisu bili direktno sekvencirani, ali su njihove aminokiselinske sekvence poznate putem "konceptualne translacije" poznate iRNK sekvence. 
* [[mutageneza usmerena na položaj]] omogućava formiranje i testiranje novih varijanti proteina radu određivanja uticaja strukturnih promena na funkciju proteina.
* umetanje proteinskih oznaka kao što je [[Polihistidinska oznaka|His oznaka]]. (pogledajte ''[[zeleni fluorescentni protein]]'')
* Proteini koji učestvuju u ljudskim bolestima se mogu identifikovati nalaženjem [[alel]]a bolesti i drugih fenotipskih karakteristika koristeći metode kao što je [[Vezani geni|proračun LOD bodovanja]].

== Detekcija proteina ==
*mikroskopija, [[imunobojenje|proteinsko imunobojenje]]
*[[Imunoprecipitacija|Proteinska imunoprecipitacija]] 
*[[Imunoelektroforeza]]
*[[Imunobloting]]
*[[Test bicinhoninske kiseline|BCA proteinski test]] (za merenje koncentracije proteina)
*[[Vestern blot]]
*[[Spektrofotometrija]]
*[[Enzimski test]]

== Proteinsko prečišćavanje ==
*Proteinska izolacija
**Hromatografski metodi: [[jonska razmena]], [[ekskluziona hromatografija]], [[afinitetna hromatografija]]
*Proteinska ekstrakcija i rastvaranje
*Metodi za određivanje proteinske koncentracije, [[Bradfordov proteinski test]]
*Koncentrisanje proteinskih rastvora
*[[Gelna elektroforeza]]
*[[Elektrofokusiranje]]

== Proteinska struktura ==
*[[rendgenska strukturna analiza|Rendgenska kristalografija]]
*[[Nuklearno magnetno rezonantna spektroskopija proteina|Proteinski NMR]]

== Protein-Protein interakcije ==
* [[Kvaščev dvohibridni sistem]]
* [[Test komplementacije proteinskih fragmenata]]
* [[Koimunoprecipitacija]]
* [[Afinitetna hromatografija]] i [[masena spektrometrija]]

== Protein-DNK interakcije ==
* [[ChIP-na-čipu]]
* [[Chip sekvenciranje|ChIP sekvenciranje]]
* [[DamID]]
* [[Mikroskalna termoforeza]]

== Računarske metode ==
*[[Molekulska dinamika]]
*[[Predviđanje proteinske strukture]] 
*[[Poravnavanje sekvenci]] (poređenje sekvenci, uključujući [[BLAST]])
*[[Strukturno poravnavanje proteina]]
*Proteinska ontologija ([[Ontologija gena]])

== Druge metode ==
*[[Vodonično-deuterijumska razmena]]
*[[Masena spektrometrija]]
*[[Proteinsko sekvenciranje]] 
*[[Sinteza proteina|Proteinska sinteza]]
*[[Proteomika]]
*[[Uzimanje peptidnih masenih otisaka]] ({{jez-eng-lat|Peptide mass fingerprinting}})
*[[Test vezivanja liganda]]
*[[Istern bloting]]
*metaboličko obeležavanje
**obeležavanje teškim izotopima
**[[Radioaktivnost u biološkim istraživanjima|obeležavanje radioaktivnim izotopima]]
}}

== Literatura ==
* "Protein Methods", 2nd Edition by Daniel M. Bollag, Michael D. Rozycki and Stuart J. Edelstein (1996) Published by Wiley Publishers {{ISBN|0-471-11837-0}}.
{{-}}
{{Proteinske teme-lat}}
{{Metode za određivanje strukture proteina-lat}}

[[Kategorija:Proteinske metode| ]]