S Barcelonou podepsal v červenci 2013 smlouvu na dvě sezóny.[1] V srpnu 2013 získal s týmem první trofej – španělský Superpohár Supercopa de España 2013, v němž si FC Barcelona poradila s Atléticem Madrid.[2] 26. října 2013 porazil jeho tým na Camp NouReal Madrid 2:1, šlo o jeho první vítězství v El Classicu (jak bývají souboje Barcelony s Realem Madrid nazývané). První porážka v soutěžním zápase přišla 26. listopadu 2013 během jeho 21. utkání v pozici trenéra Barcelony, mužstvo podlehlo v Lize mistrů 1:2 Ajaxu Amsterdam.[3] Poté, co v sezoně 2013/14 nevyhrál s Barcelonou žádnou trofej, rozhodl se v květnu 2014 na funkci rezignovat, ačkoli měl smlouvu ještě na další sezonu.[4]