El Torneo del Interior 1993-94 fue la novena edición de este certamen. De este modo, ocupaba la tercera categoría del fútbol argentino. Los equipos provenían directamente de las distintas ligas regionales argentinas y al ser el único torneo para estos equipos, no incluía descensos. Fue la segunda edición, junto la edición inaugural de 1986, que otorgó ascensos directos a la Primera B Nacional, ya que anteriormente los ganadores de las zonas disputaban los torneos reducidos con 4 equipos de la Primera B.
Se jugó un certamen en dos etapas. La primera etapa regionalizada con 98 equipos provenientes generalmente de las ligas más pequeñas; divididos en 5 regiones geográficas, que a su vez estaban divididas en zonas, y clasificaban a 2 equipos por región a la segunda etapa. La segunda etapa estuvo conformada por 33 equipos, incluidos los 10 clasificados de la etapa anterior y equipos que clasificaron directamente a esta etapa, generalmente de las ligas regionales más grandes. Consistió en 4 rondas, la primera conformada por 6 zonas de grupos, la segunda por 3, la tercera por 2 y la final a partido de ida y vuelta, donde el ganador obtendría el único ascenso a la Primera B Nacional.
Las ligas regionales invitadas determinaron el método de clasificación de los equipos al torneo.