Noviherbaspirillum humi
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Phylum | Pseudomonadota |
| Classe | Betaproteobacteria |
| Ordre | Burkholderiales |
| Famille | Oxalobacteraceae |
| Genre | Noviherbaspirillum |
Noviherbaspirillum humi est une espèce de bactéries gram-négatives de la famille des Oxalobacteraceae.
Historique
[modifier | modifier le code]Les deux principales souches de cette espèce, dont la souche type U15, ont été isolées à partir de prélèvements de sols dans la ville de Sadky en Ukraine en 2013[1].
Description
[modifier | modifier le code]Ce sont des bactéries à coloration de Gram négatives, mobiles, et ne formant pas de spores[1]. Elles sont aussi aérobies facultatives et en forme de petits bacilles ne possédant qu'un unique flagelle[2].
La croissance de ces bactéries est optimale à 30 °C et un pH de 7.0[1].
Les acides gras majoritaires sont les trois suivants : C16:1ω7c, C16:1ω6c) et C16:0. La quinone respiratoire majoritaire est l'ubiquinone 8[1]. Cette espèce est caractérisée par un profil de lipides polaires formé de phosphatidyléthanolamine, phosphatidylglycérol, diphosphatidylglycérol, d'aminophospholipides, d'aminolipides non identifiés et de lipides aussi non identifiés. Elles contiennent aussi de la putrescine et 2-hydroxyputrescine comme polyamines principales[1].
Le contenu en bases nucléiques G+C est de 61,2 %[1].
Taxonomie
[modifier | modifier le code]Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Noviherbaspirillum humi Sundararaman et al. 2017[3] bien que la description ait eu lieu en 2016[1]. Ce nom a été validé dans l'International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, un an plus tard[4].
La souche type de l'espèce N. humi est la souche U15 qui a été déposée dans des banques de cultures bactériennes sous les identifiants JCM 19873 et KEMB 7305-102[1].
Étymologie
[modifier | modifier le code]L'étymologie du nom de cette espèce est la suivante : hu’mi. L. gen. fem. n. humi, du sol, à l'origine la source de la souche type de cette espèce[3].
Phylogénie
[modifier | modifier le code]L'analyse phylogénétique des séquences du gène de l'ARN ribosomal 16S a démontré que ces bactéries appartiennent au phylum Proteobacteria (désormais appelées Pseudomonadota), à la classe des Betaproteobacteria, à l'ordre des Oxalobacterales (désormais dans les Burkholderiales) et à la famille des Oxalobacteraceae. Ces analyses ont aussi montré que l'espèce bactérienne la plus proche serait Noviherbaspirillum malthae puis Noviherbaspirillum suwonense[5]. En 2020, la nouvelle espèce Noviherbaspirillum galbum est aussi décrite comme l'une des plus proche de N. humi avec une similarité de séquence de 96,4 %[6].
Références
[modifier | modifier le code]- Sundararaman, Srinivasan et Lee 2026, p. 697.
- Sundararaman, Srinivasan et Lee 2026, p. 699.
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 12 mars 2024
- (en) Aharon Oren et George M Garrity, « Validation list no. 174. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 67, no 3, , p. 529-531 (DOI 10.1099/ijsem.0.001845)
- Sundararaman, Srinivasan et Lee 2026, p. 700.
- (en) Yuna Park, Soohyun Maeng, Sang Eun Lee et Sang Eun Lee et al., « Noviherbaspirillum galbum sp. nov., a bacterium isolated from soil », Archives of Microbiology, vol. 203, no 3, , p. 1-6 (DOI 10.1007/s00203-020-02076-7)
Bibliographie
[modifier | modifier le code]- Publication originale (en) Aravind Sundararaman, Sathiyaraj Srinivasan et Sang-Seob Lee, « Noviherbaspirillum humi sp. nov., isolated from soil. », Antonie Van Leeuwenhoek, vol. 109, no 3, , p. 697-704 (DOI 10.1007/s10482-016-0670-0).
Liens externes
[modifier | modifier le code]- (fr + en) Référence EOL : Noviherbaspirillum humi (consulté le )
- (fr + en) Référence GBIF : Noviherbaspirillum humi Sundararaman et al., 2017 (consulté le )
- (en) Référence LPSN : Noviherbaspirillum humi Sundararaman et al. 2017 (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Noviherbaspirillum humi (taxons inclus) (consulté le )
