Metabolomika

Metabolomika je naučna studija hemijskih procesa u kojima učestvuju metaboliti. Metabolomika je sistematsko izučavanje jedinstvenih hemijskih otisaka koji su specifčni za ćelijske procese. Ona je studija motaboličkih profila malih molekula.^[1] Metabolom je kolekcija svih metabolita u biološkoj ćeliji, tkivu, organu ili organizmu, koji su krajnji produkti ćelijskih procesa.^[2] Dok celokupni podaci iRNK genske ekspresije i proteomskih analiza ne sadrže potpunu informaciju o ćelijskim procesima, metabolički profil može da pruži trenutnu sliku ćelijske fiziologije. Jedan od izazova sistemske biologije i funkcionalne genomike je integracija proteomske, transkriptomske, i metabolomske informacije da bi se formirala kompletnija slika živih organizama.

Reference

^ Daviss, Bennett (2005). „Growing pains for metabolomics”. The Scientist. 19 (8): 25—28.
^ Jordan KW, Nordenstam J, Lauwers GY, Rothenberger DA, Alavi K, Garwood M, Cheng LL (2009). „Metabolomic characterization of human rectal adenocarcinoma with intact tissue magnetic resonance spectroscopy”. Diseases of the Colon & Rectum. 52 (3): 520—5. PMC 2720561  . PMID 19333056. doi:10.1007/DCR.0b013e31819c9a2c.

Literatura

Tomita M, Nishioka T (2005). Metabolomics: The Frontier of Systems Biology. Springer. ISBN 4-431-25121-9.
Weckwerth, Wolfram (2006). Metabolomics: Methods And Protocols (Methods in Molecular Biology). Humana Press. OCLC 493824826. ISBN 1-58829-561-3.
Fan TW, Lorkiewicz PK, Sellers K, Moseley HN, Higashi RM, Lane AN (2012). „Stable isotope-resolved metabolomics and applications for drug development”. Pharmacol. Ther. 133 (3): 366—91. PMC 3471671  . PMID 22212615. doi:10.1016/j.pharmthera.2011.12.007.
Ellis DI, Goodacre R (2006). „Metabolic fingerprinting in disease diagnosis: biomedical applications of infrared and Raman spectroscopy” (PDF). Analyst. 131 (8): 875—885. Bibcode:2006Ana...131..875E. PMID 17028718. doi:10.1039/b602376m.
Claudino WM, Quatronne A, Pestrim M, Biganzoli L, Bertini, Di Leo A (2007). „Metabolomics: Available results, current research projects in breast cancer, and future applications”. J Clin Oncol. 25 (19): 2840—6. PMID 17502626. doi:10.1200/JCO.2006.09.7550. Архивирано из оригинала 20. 01. 2008. г. Приступљено 05. 11. 2013.
Ellis DI, Dunn WB, Griffin JL, Allwood JW, Goodacre R (2007). „Metabolic fingerprinting as a diagnostic tool” (PDF). Pharmacogenomics. 8 (9): 1243—1266. PMID 17924839. doi:10.2217/14622416.8.9.1243.
Bundy JG, Davey MP, Viant, MR (2009). „Environmental metabolomics: A critical review and future perspectives”. Metabolomics. 5: 3—21. doi:10.1007/s11306-008-0152-0. Архивирано из оригинала 15. 12. 2019. г. Приступљено 05. 11. 2013.
Kenneth Haug, Reza M. Salek, Pablo Conesa, Janna Hastings, Paula de Matos, Mark Rijnbeek, Tejasvi Mahendrakar, Mark Williams, Steffen Neumann, Philippe Rocca-Serra, Eamonn Maguire, Alejandra González-Beltrán, Susanna-Assunta Sansone, Julian L. Griffin and Christoph Steinbeck. (2013). „MetaboLights-- an open-access general-purpose repository for metabolomics studies and associated meta-data.”. Nucl. Acids Res. 41 (D1): D781—D786. doi:10.1093/nar/gks1004.

Spoljašnje veze

Metabolism на сајту Curlie (језик: енглески)
HMDB
METLIN
XCMS
LCMStats
Metabolights
Global map of metabolomics labs

[1] Daviss, Bennett (2005). „Growing pains for metabolomics”. The Scientist. 19 (8): 25—28.

[2] Jordan KW, Nordenstam J, Lauwers GY, Rothenberger DA, Alavi K, Garwood M, Cheng LL (2009). „Metabolomic characterization of human rectal adenocarcinoma with intact tissue magnetic resonance spectroscopy”. Diseases of the Colon & Rectum. 52 (3): 520—5. PMC 2720561  . PMID 19333056. doi:10.1007/DCR.0b013e31819c9a2c.

[1]

[2]