Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ZNF219
Ідентифікатори
Символи
ZNF219 , ZFP219, zinc finger protein 219
Зовнішні ІД
OMIM : 605036 MGI: 1917140 HomoloGene: 9504 GeneCards: ZNF219
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • histamine receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• integral component of membrane • клітинне ядро
Біологічний процес
• multicellular organism development • G protein-coupled receptor signaling pathway • regulation of neurotransmitter levels • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of chondrocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • limb bud formation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 14: 21.09 – 21.1 Mb
Хр. 14: 52.24 – 52.26 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ZNF219 (англ. Zinc finger protein 219 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 722 амінокислот , а молекулярна маса — 76 877[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEGSRPRAPS GHLAPSPPAF DGELDLQRYS NGPAVSAGSL GMGAVSWSES
RAGERRFPCP VCGKRFRFNS ILALHLRAHP GAQAFQCPHC GHRAAQRALL
RSHLRTHQPE RPRSPAARLL LELEERALLR EARLGRARSS GGMQATPATE
GLARPQAPSS SAFRCPYCKG KFRTSAERER HLHILHRPWK CGLCSFGSSQ
EEELLHHSLT AHGAPERPLA ATSAAPPPQP QPQPPPQPEP RSVPQPEPEP
EPEREATPTP APAAPEEPPA PPEFRCQVCG QSFTQSWFLK GHMRKHKASF
DHACPVCGRC FKEPWFLKNH MKVHASKLGP LRAPGPASGP ARAPQPPDLG
LLAYEPLGPA LLLAPAPTPA ERREPPSLLG YLSLRAGEGR PNGEGAEPGP
GRSFGGFRPL SSALPARARR HRAEEPEEEE EVVEAEEETW ARGRSLGSLA
SLHPRPGEGP GHSASAAGAQ ARSTATQEEN GLLVGGTRPE GGRGATGKDC
PFCGKSFRSA HHLKVHLRVH TGERPYKCPH CDYAGTQSGS LKYHLQRHHR
EQRSGAGPGP PPEPPPPSQR GSAPQSGAKP SPQPATWVEG ASSPRPPSSG
AGPGSRRKPA SPGRTLRNGR GGEAEPLDLS LRAGPGGEAG PGGALHRCLF
CPFATGAPEL MALHLQVHHS RRARGRRPPQ ADASPPYARV PSGETPPSPS
QEGEEGSGLS RPGEAGLGGQ ER
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Sakai T., Toyoda A., Hashimoto K., Maeda H. (2000). Isolation and characterization of a novel zinc finger gene, ZNF219, and mapping to the human chromosome 14q11 region. DNA Res . 7 : 137—141. PMID 10819330 DOI :10.1093/dnares/7.2.137
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші