Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXB4
Ідентифікатори
Символи
HOXB4 , HOX-2.6, HOX2, HOX2F, homeobox B4
Зовнішні ІД
OMIM : 142965 MGI: 96185 HomoloGene: 32095 GeneCards: HOXB4
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • центросома
Біологічний процес
• embryonic skeletal system morphogenesis • multicellular organism development • definitive hemopoiesis • somatic stem cell division • skeletal system morphogenesis • проліферація • positive regulation of stem cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • spleen development • hematopoietic stem cell differentiation • morphogenesis of an epithelial sheet • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • bone marrow development • кровотворення • skeletal system development
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 48.58 – 48.58 Mb
Хр. 11: 96.21 – 96.21 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HOXB4 (англ. Homeobox B4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 251 амінокислот , а молекулярна маса — 27 604[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAMSSFLINS NYVDPKFPPC EEYSQSDYLP SDHSPGYYAG GQRRESSFQP
EAGFGRRAAC TVQRYAACRD PGPPPPPPPP PPPPPPPGLS PRAPAPPPAG
ALLPEPGQRC EAVSSSPPPP PCAQNPLHPS PSHSACKEPV VYPWMRKVHV
STVNPNYAGG EPKRSRTAYT RQQVLELEKE FHYNRYLTRR RRVEIAHALC
LSERQIKIWF QNRRMKWKKD HKLPNTKIRS GGAAGSAGGP PGRPNGGPRA
L
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші