Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ZNF10
Ідентифікатори
Символи
ZNF10 , KOX1, zinc finger protein 10
Зовнішні ІД
OMIM : 194538 HomoloGene: 130674 GeneCards: ZNF10
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 133.13 – 133.16 Mb
н/д
PubMed search
[ 1]
н/д Вікідані
ZNF10 (англ. Zinc finger protein 10 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 573 амінокислот , а молекулярна маса — 66 455[ 3] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDAKSLTAWS RTLVTFKDVF VDFTREEWKL LDTAQQIVYR NVMLENYKNL
VSLGYQLTKP DVILRLEKGE EPWLVEREIH QETHPDSETA FEIKSSVSSR
SIFKDKQSCD IKMEGMARND LWYLSLEEVW KCRDQLDKYQ ENPERHLRQV
AFTQKKVLTQ ERVSESGKYG GNCLLPAQLV LREYFHKRDS HTKSLKHDLV
LNGHQDSCAS NSNECGQTFC QNIHLIQFAR THTGDKSYKC PDNDNSLTHG
SSLGISKGIH REKPYECKEC GKFFSWRSNL TRHQLIHTGE KPYECKECGK
SFSRSSHLIG HQKTHTGEEP YECKECGKSF SWFSHLVTHQ RTHTGDKLYT
CNQCGKSFVH SSRLIRHQRT HTGEKPYECP ECGKSFRQST HLILHQRTHV
RVRPYECNEC GKSYSQRSHL VVHHRIHTGL KPFECKDCGK CFSRSSHLYS
HQRTHTGEKP YECHDCGKSF SQSSALIVHQ RIHTGEKPYE CCQCGKAFIR
KNDLIKHQRI HVGEETYKCN QCGIIFSQNS PFIVHQIAHT GEQFLTCNQC
GTALVNTSNL IGYQTNHIRE NAY
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Thiesen H.-J. (1990). Multiple genes encoding zinc finger domains are expressed in human T cells. New Biol . 2 : 363—374. PMID 2288909
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші