En raison du nombre important de matchs reportés, le format est modifié pour cette saison.
Les dix meilleurs clubs du pays sont regroupés au sein d'une poule unique où ils s'affrontent trois fois. A l'issue de cette phase, les six premiers s'affrontent une fois à domicile ou à l'extérieur. De même, les quatre derniers s'affrontent entre eux une fois sous le même format. En fin de saison, le dernier du classement est relégué et remplacé par le champion de deuxième division, tandis que le 9e affronte le vice-champion de D2 en barrage de promotion-relégation.
Le championnat délivre deux places pour les compétitions continentales : le champion d'Estonie se qualifie pour le tour préliminaire de la Ligue des champions de l'UEFA 2022-2023 tandis que le deuxième du classement obtient son billet pour le premier tour de qualification de la Ligue Europa Conférence 2022-2023. La deuxième place en Ligue Europa Conférence est réservée au vainqueur de la Coupe d'Estonie, ou au 3e du classement final, si le vainqueur de la Coupe a terminé le championnat parmi les deux premiers.
Le classement est calculé avec le barème de points suivant : une victoire vaut trois points, le match nul un. La défaite ne rapporte aucun point.
Critères de départage :
À la fin de la saison, l'avant-dernier de Meistriliiga affronte la deuxième meilleure équipe d'Esiliiga (qui n'est pas une équipe réserve) pour tenter de se maintenir.
↑ a et bOn ne peut pas exactement parler de promotion pour ces clubs puisqu'ils ont directement rejoint la Liga dès 1992, date de création de ce championnat. Depuis cette date, ils n'ont jamais connu de relégation.