OGG1

OGG1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1EBM, 1FN7, 1HU0, 1KO9, 1LWV, 1LWW, 1LWY, 1M3H, 1M3Q, 1N39, 1N3A, 1N3C, 1YQK, 1YQL, 1YQM, 1YQR, 2I5W, 2NOB, 2NOE, 2NOF, 2NOH, 2NOI, 2NOL, 2NOZ, 2XHI, 3IH7, 3KTU, 5AN4
Ідентифікатори
Символи	OGG1, HMMH, HMUTM, OGH1, 8-oxoguanine DNA glycosylase
Зовнішні ІД	OMIM: 601982 MGI: 1097693 HomoloGene: 1909 GeneCards: OGG1
Пов'язані генетичні захворювання
	nonpapillary renal cell carcinoma
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • microtubule binding; • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds; • oxidized purine DNA binding; • каталітична активність; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • oxidized purine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity; • lyase activity; • endonuclease activity; • 8-oxo-7,8-dihydroguanine DNA N-glycosylase activity; • hydrolase activity; • damaged DNA binding; • DNA N-glycosylase activity; • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity;
Клітинна компонента	• мітохондрія; • nuclear matrix; • клітинне ядро; • nuclear speck; • нуклеоплазма; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• depurination; • nucleotide-excision repair; • response to estradiol; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • response to light stimulus; • GO:0010260 старіння людини; • negative regulation of apoptotic process; • cellular response to cadmium ion; • GO:0001306 response to oxidative stress; • depyrimidination; • acute inflammatory response; • response to radiation; • response to folic acid; • обмін речовин; • response to ethanol; • nucleotide-excision repair, DNA incision; • negative regulation of double-strand break repair via single-strand annealing; • base-excision repair; • cellular response to DNA damage stimulus; • GO:0100026 Репарація ДНК; • base-excision repair, AP site formation; • telomere maintenance via telomerase;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	4968
	18294
	ENSG00000114026
	ENSMUSG00000030271
	O15527
	O08760
NM_002542; NM_016819; NM_016820; NM_016821; NM_016826;
	NM_016827; NM_016828; NM_016829; NM_001354648; NM_001354649; NM_001354650; NM_001354651; NM_001354652
	NM_010957
NP_002533; NP_058212; NP_058213; NP_058214; NP_058434;
	NP_058436; NP_058437; NP_058438; NP_001341577; NP_001341578; NP_001341579; NP_001341580; NP_001341581; NP_058436.1; NP_058434.1
	NP_035087
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

OGG1 (англ. 8-oxoguanine DNA glycosylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 345 амінокислот, а молекулярна маса — 38 782^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPARALLPRR	MGHRTLASTP	ALWASIPCPR	SELRLDLVLP	SGQSFRWREQ
SPAHWSGVLA	DQVWTLTQTE	EQLHCTVYRG	DKSQASRPTP	DELEAVRKYF
QLDVTLAQLY	HHWGSVDSHF	QEVAQKFQGV	RLLRQDPIEC	LFSFICSSNN
NIARITGMVE	RLCQAFGPRL	IQLDDVTYHG	FPSLQALAGP	EVEAHLRKLG
LGYRARYVSA	SARAILEEQG	GLAWLQQLRE	SSYEEAHKAL	CILPGVGTKV
ADCICLMALD	KPQAVPVDVH	MWHIAQRDYS	WHPTTSQAKG	PSPQTNKELG
NFFRSLWGPY	AGWAQAVLFS	ADLRQSRHAQ	EPPAKRRKGS	KGPEG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, глікозидаз. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мітохондрії.

Література

Rosenquist T.A., Zharkov D.O., Grollman A.P. (1997). Cloning and characterization of a mammalian 8-oxoguanine DNA glycosylase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 7429—7434. PMID 9207108 DOI:10.1073/pnas.94.14.7429
Radicella J.P., Dherin C., Desmaze C., Fox M.S., Boiteux S. (1997). Cloning and characterization of hOGG1, a human homolog of the OGG1 gene of Saccharomyces cerevisiae. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8010—8015. PMID 9223305 DOI:10.1073/pnas.94.15.8010
Lu R., Nash H.M., Verdine G.L. (1997). A mammalian DNA repair enzyme that excises oxidatively damaged guanines maps to a locus frequently lost in lung cancer. Curr. Biol. 7: 397—407. PMID 9197244 DOI:10.1016/S0960-9822(06)00187-4
Kuo F.C., Sklar J.L. (1997). Augmented expression of a human gene for 8-oxoguanine DNA glycosylase (MutM) in B lymphocytes of the dark zone in lymph node germinal centers. J. Exp. Med. 186: 1547—1556. PMID 9348312 DOI:10.1084/jem.186.9.1547
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Boiteux S., Radicella J.P. (2000). The human OGG1 gene: structure, functions, and its implication in the process of carcinogenesis. Arch. Biochem. Biophys. 377: 1—8. PMID 10775435 DOI:10.1006/abbi.2000.1773