BtKY72病毒
外观
BtKY72病毒 | |
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病毒分類 | |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
门: | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
纲: | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠状病毒科 Coronaviridae |
属: | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
亚属: | SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus |
种: | 嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒 SARSr-CoV
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毒株: | BtKY72病毒 BtKY72
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BtKY72病毒(BtKY72/Rhinolophus sp./Kenya/2007)是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒(SARSr-CoV)的一個病毒株,在肯亞菊頭蝠屬蝙蝠的糞便樣本中發現,其基因組已被完整定序,於2019年發表。
病毒學
[编辑]BtKY72病毒的基因組長29259nt,基因順序為複製酶(ORF1a/b)-刺突蛋白(S)-ORF3a-外膜蛋白(E)-膜蛋白(M)-ORF6-ORF7a-ORF7b-衣殼蛋白(N),相較於SARS病毒和多數蝙蝠SARS相關病毒,此病毒缺乏ORF3b與ORF8[1]。在SARSr-CoV中,此病毒與2010年發表、在保加利亞發現的BM48-31病毒關係最接近,兩者基因組序列相似度為81%,BM48-31病毒亦不具有ORF8[1][2]。
分類
[编辑]種系發生學研究結果顯示BtKY72病毒與BM48-31病毒組成的演化支是SARSr-CoV演化樹的基群,此演化支與其他SARSr-CoV分家早於SARS-CoV和SARS-CoV-2分家的時間[3][4]。
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參考文獻
[编辑]- ^ 1.0 1.1 Tao Y, Tong S. Complete Genome Sequence of a Severe Acute Respiratory Syndrome-Related Coronavirus from Kenyan Bats.. Microbiol Resour Announc. 2019, 8 (28). PMC 6624766 . PMID 31296683. doi:10.1128/MRA.00548-19.
- ^ Drexler JF, Gloza-Rausch F, Glende J, Corman VM, Muth D, Goettsche M; et al. Genomic characterization of severe acute respiratory syndrome-related coronavirus in European bats and classification of coronaviruses based on partial RNA-dependent RNA polymerase gene sequences.. J Virol. 2010, 84 (21): 11336–49. PMC 2953168 . PMID 20686038. doi:10.1128/JVI.00650-10.
- ^ Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H; et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding.. Lancet. 2020, 395 (10224): 565–574. PMC 7159086 . PMID 32007145. doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8.
- ^ Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2.. Nat Microbiol. 2020, 5 (4): 536–544. PMC 7095448 . PMID 32123347. doi:10.1038/s41564-020-0695-z.