2016년 AFC컵은 2016년에 개최된 13번째 AFC컵이다.
2016 AFC컵 대회 경기 일정은 다음과 같다.[2]
예선 라운드는 조별 예선 형식으로 진행된다. 팀당 2경기를 치르며 예선 라운드 1위 팀은 플레이오프 또는 조별 예선에 진출하게 된다.
단판 승부로 진행되며 90분 내에 승부가 나지 않으면 연장전, 승부차기가 진행된다. 플레이오프 라운드 승자는 조별 예선에 진출한다.
조별 예선 추첨은 2015년 12월 10일에 진행되었다. 같은 협회에 속해 있는 클럽은 서로 같은 조에 편성되지 않는다. 조별 예선은 32개 팀을 8개 조로 나누어 홈 앤 어웨이 방식으로 진행되며 각 조의 1, 2위 팀이 16강전에 진출한다. 승리시 승점 3점, 무승부시 승점 1점을 얻는다. 만약 승점이 같은 팀이 있을 경우 아래와 같은 방법으로 동점자를 가린다.
16강전은 조별 예선의 결과에 따라 각 조 1위와 다른 조 2위가 서로 맞붙으며 각 조 1위의 홈에서 단판 승부로 치러진다.