Zámek byl vybudován po vzniku samostatného statku v Hlubočanech jako správcovské a rezidenční sídlo tehdejšího dvora. Bylo to asi kolem roku 1716 kdy cisterciátský klášter z Brna odprodal statek Bernartu Bravantskému z Chobřan. V roce 1948 přešel do majetku státu. Dnes je dvůr se zámkem v soukromých rukou.
Hlubočany se poprvé připomínají již v roce 1141 jako majetek olomouckého biskupství, později ale přecházejí do světských rukou. V roce 1325 Jindřich I. z Lipé daroval ves cisterciáckému klášteru na Starém Brně, jenž obec vlastnil až do roku 1716, kdy ji jako samostatný statek odprodal Bernartu Bravantskému z Chobřan. Snad v té době byl na západním okraji vsi vybudován dvůr jehož ústřední budovou se stal zámek v jihozápadní části dvora. Zámek plnil správcovskou a rezidenční funkci, a to až do roku1858, kdy došlo ke spojení s habrovanským panstvím, jehož tehdejší majitel Arnošt Jan Herring - Frankendorf sídlil na svém zámku v Habrovanech. V rove 1948 v rámci revize I. pozemkové reformy přešel dvůr se zámkem do majetku státu. Sídlila v něm celá řada zemědělských organizací, od té doby zámek chátral. V rámci restituce v roce 1989 přechází zpět do rukou potomků majitelů bývalého statku. Současný majitel, mmj. velice ochotný, chce jako milovník habrovanské historie dvůr postupně renovovat. V současné době je to jednopatrová již nezastřešená budova.
D. Dohňanský, zdroj: F.Musil - Neznámé zámky Moravy a Slezska, 12.5. 2020