Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ARNT
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
4PKY , 1X0O , 2A24 , 2B02 , 2HV1 , 2K7S , 3F1N , 3F1O , 3F1P , 3H7W , 3H82 , 4EQ1 , 4GHI , 4GS9 , 4H6J , 4LPZ , 4XT2
Ідентифікатори
Символи
ARNT , HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
Зовнішні ІД
OMIM : 126110 MGI: 88071 HomoloGene: 1261 GeneCards: ARNT
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • aryl hydrocarbon receptor binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein homodimerization activity • sequence-specific double-stranded DNA binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
Клітинна компонента
• цитоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро • ядерні тільця
Біологічний процес
• positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • диференціація клітин • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of endothelial cell proliferation • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress • positive regulation of erythrocyte differentiation • embryonic placenta development • mRNA transcription by RNA polymerase II • positive regulation of protein sumoylation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • intracellular receptor signaling pathway • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • positive regulation of vascular endothelial growth factor production • positive regulation of glycolytic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of hormone biosynthetic process • xenobiotic metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 150.81 – 150.88 Mb
Хр. 3: 95.34 – 95.4 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ARNT (англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 789 амінокислот , а молекулярна маса — 86 636[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAATTANPEM TSDVPSLGPA IASGNSGPGI QGGGAIVQRA IKRRPGLDFD
DDGEGNSKFL RCDDDQMSND KERFARSDDE QSSADKERLA RENHSEIERR
RRNKMTAYIT ELSDMVPTCS ALARKPDKLT ILRMAVSHMK SLRGTGNTST
DGSYKPSFLT DQELKHLILE AADGFLFIVS CETGRVVYVS DSVTPVLNQP
QSEWFGSTLY DQVHPDDVDK LREQLSTSEN ALTGRILDLK TGTVKKEGQQ
SSMRMCMGSR RSFICRMRCG SSSVDPVSVN RLSFVRNRCR NGLGSVKDGE
PHFVVVHCTG YIKAWPPAGV SLPDDDPEAG QGSKFCLVAI GRLQVTSSPN
CTDMSNVCQP TEFISRHNIE GIFTFVDHRC VATVGYQPQE LLGKNIVEFC
HPEDQQLLRD SFQQVVKLKG QVLSVMFRFR SKNQEWLWMR TSSFTFQNPY
SDEIEYIICT NTNVKNSSQE PRPTLSNTIQ RPQLGPTANL PLEMGSGQLA
PRQQQQQTEL DMVPGRDGLA SYNHSQVVQP VTTTGPEHSK PLEKSDGLFA
QDRDPRFSEI YHNINADQSK GISSSTVPAT QQLFSQGNTF PPTPRPAENF
RNSGLAPPVT IVQPSASAGQ MLAQISRHSN PTQGATPTWT PTTRSGFSAQ
QVATQATAKT RTSQFGVGSF QTPSSFSSMS LPGAPTASPG AAAYPSLTNR
GSNFAPETGQ TAGQFQTRTA EGVGVWPQWQ GQQPHHRSSS SEQHVQQPPA
QQPGQPEVFQ EMLSMLGDQS NSYNNEEFPD LTMFPPFSE
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Wang G.L., Jiang B.-H., Rue E.A., Semenza G.L. (1995). Hypoxia-inducible factor 1 is a basic-helix-loop-helix-PAS heterodimer regulated by cellular O2 tension. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 92 : 5510—5514. PMID 7539918 DOI :10.1073/pnas.92.12.5510
Reyes H., Reisz-Porszasz S., Hankinson O. (1992). Identification of the Ah receptor nuclear translocator protein (Arnt) as a component of the DNA binding form of the Ah receptor. Science . 256 : 1193—1195. PMID 1317062 DOI :10.1126/science.256.5060.1193
Bacsi S.G., Hankinson O. (1996). Functional characterization of DNA-binding domains of the subunits of the heterodimeric aryl hydrocarbon receptor complex imputing novel and canonical basic helix-loop-helix protein-DNA interactions. J. Biol. Chem . 271 : 8843—8850. PMID 8621524 DOI :10.1074/jbc.271.15.8843
Nguyen T.A., Hoivik D., Lee J.-E., Safe S. (1999). Interactions of nuclear receptor coactivator/corepressor proteins with the aryl hydrocarbon receptor complex. Arch. Biochem. Biophys. 367 : 250—257. PMID 10395741 DOI :10.1006/abbi.1999.1282
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші