Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MSX2
Ідентифікатори
Символи
MSX2 , CRS2, FPP, HOX8, MSH, PFM, PFM1, Msh homeobox 2
Зовнішні ІД
OMIM : 123101 MGI: 97169 HomoloGene: 1837 GeneCards: MSX2
Пов'язані генетичні захворювання
Parietal foramina with cleidocranial dysplasia , parietal foramina [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • гіалоплазма • nuclear speck
Біологічний процес
• negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of timing of catagen • negative regulation of keratinocyte differentiation • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • embryonic limb morphogenesis • frontal suture morphogenesis • mammary gland epithelium development • BMP signaling pathway involved in heart development • enamel mineralization • осифікація • anterior/posterior pattern specification • bone morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to growth factor stimulus • activation of meiosis • endochondral bone growth • wound healing, spreading of epidermal cells • BMP signaling pathway • embryonic digit morphogenesis • positive regulation of mesenchymal cell apoptotic process • multicellular organism development • embryonic hindlimb morphogenesis • negative regulation of CREB transcription factor activity • outflow tract morphogenesis • bone trabecula formation • Загоєння ран • regulation of apoptotic process • chondrocyte development • osteoblast development • positive regulation of osteoblast differentiation • cranial suture morphogenesis • negative regulation of fat cell differentiation • branching involved in mammary gland duct morphogenesis • outflow tract septum morphogenesis • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • osteoblast differentiation • epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation • positive regulation of BMP signaling pathway • signal transduction involved in regulation of gene expression • cellular response to estradiol stimulus • embryonic forelimb morphogenesis • embryonic nail plate morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • cartilage development • stem cell differentiation • odontogenesis • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 5: 174.72 – 174.73 Mb
н/д
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
MSX2 (англ. Msh homeobox 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 267 амінокислот , а молекулярна маса — 28 897[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MASPSKGNDL FSPDEEGPAV VAGPGPGPGG AEGAAEERRV KVSSLPFSVE
ALMSDKKPPK EASPLPAESA SAGATLRPLL LSGHGAREAH SPGPLVKPFE
TASVKSENSE DGAAWMQEPG RYSPPPRHMS PTTCTLRKHK TNRKPRTPFT
TSQLLALERK FRQKQYLSIA ERAEFSSSLN LTETQVKIWF QNRRAKAKRL
QEAELEKLKM AAKPMLPSSF SLPFPISSPL QAASIYGASY PFHRPVLPIP
PVGLYATPVG YGMYHLS
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , остеогенез, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші