POU5F1

POU5F1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1OCP, 3L1P
Ідентифікатори
Символи	POU5F1, OCT3, OCT4, OTF-3, OTF3, OTF4, Oct-3, Oct-4, POU class 5 homeobox 1, Oct3/4
Зовнішні ІД	OMIM: 164177 MGI: 101893 HomoloGene: 8422 GeneCards: POU5F1
Пов'язані генетичні захворювання
синдром Стівенса — Джонсона
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • miRNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • ubiquitin protein ligase binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • мітохондрія Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • GO:1905617 negative regulation of gene silencing by miRNA • cell fate commitment involved in formation of primary germ layer • endodermal cell fate specification • anatomical structure morphogenesis • mRNA transcription by RNA polymerase II • regulation of asymmetric cell division • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • multicellular organism development • cardiac cell fate determination • response to wounding • BMP signaling pathway involved in heart induction • регуляція експресії генів • regulation of heart induction by regulation of canonical Wnt signaling pathway • blastocyst development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of SMAD protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5460	18999
Ensembl	ENSG00000230336 ENSG00000206454 ENSG00000204531 ENSG00000237582 ENSG00000229094 ENSG00000233911 ENSG00000235068	ENSMUSG00000024406
UniProt	Q01860	P20263
RefSeq (мРНК)	NM_203289 NM_001173531 NM_001285986 NM_001285987 NM_002701	NM_001252452 NM_013633
RefSeq (білок)	NP_001167002 NP_001272915 NP_001272916 NP_002692 NP_976034 NP_001272915.1	NP_001239381 NP_038661
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.16 – 31.18 Mb	Хр. 17: 35.82 – 35.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POU5F1 (англ. POU class 5 homeobox 1), більш відомий як Oct-4 (octamer-binding transcription factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот, а молекулярна маса — 38 571.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGHLASDFA		FSPPPGGGGD		GPGGPEPGWV		DPRTWLSFQG		PPGGPGIGPG
VGPGSEVWGI		PPCPPPYEFC		GGMAYCGPQV		GVGLVPQGGL		ETSQPEGEAG
VGVESNSDGA		SPEPCTVTPG		AVKLEKEKLE		QNPEESQDIK		ALQKELEQFA
KLLKQKRITL		GYTQADVGLT		LGVLFGKVFS		QTTICRFEAL		QLSFKNMCKL
RPLLQKWVEE		ADNNENLQEI		CKAETLVQAR		KRKRTSIENR		VRGNLENLFL
QCPKPTLQQI		SHIAQQLGLE		KDVVRVWFCN		RRQKGKRSSS		DYAQREDFEA
AGSPFSGGPV		SFPLAPGPHF		GTPGYGSPHF		TALYSSVPFP		EGEAFPPVSV
TTLGSPMHSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Takeda J., Seino S., Bell G.I. (1992). Human Oct3 gene family: cDNA sequences, alternative splicing, gene organization, chromosomal location, and expression at low levels in adult tissues. Nucleic Acids Res. 20: 4613—4620. PMID 1408763 DOI:10.1093/nar/20.17.4613
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wey E., Lyons G.E., Schaefer B.W. (1994). A human POU domain gene, mPOU, is expressed in developing brain and specific adult tissues. Eur. J. Biochem. 220: 753—762. PMID 7908264 DOI:10.1111/j.1432-1033.1994.tb18676.x
• Abdel-Rahman B., Fiddler M., Rappolee D., Pergament E. (1995). Expression of transcription regulating genes in human preimplantation embryos. Hum. Reprod. 10: 2787—2792. PMID 8567814 DOI:10.1093/oxfordjournals.humrep.a135792
• Lee J., Kim H.K., Han Y.-M., Kim J. (2008). Pyruvate kinase isozyme type M2 (PKM2) interacts and cooperates with Oct-4 in regulating transcription. Int. J. Biochem. Cell Biol. 40: 1043—1054. PMID 18191611 DOI:10.1016/j.biocel.2007.11.009
• Spelat R., Ferro F., Curcio F. (2012). Serine 111 phosphorylation regulates OCT4A protein subcellular distribution and degradation. J. Biol. Chem. 287: 38279—38288. PMID 23024368 DOI:10.1074/jbc.M112.386755

Див. також

• Хромосома 6