SATB2

SATB2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WI3, 1WIZ, 2CSF
Ідентифікатори
Символи	SATB2, GLSS, SATB homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608148 MGI: 2679336 HomoloGene: 32249 GeneCards: SATB2
Пов'язані генетичні захворювання
неспецифічний виразковий коліт, isolated cleft palate, chromosome 2q32-q33 deletion syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • histone deacetylase complex • transcription regulator complex • nuclear matrix • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain • embryonic skeletal system morphogenesis • cellular response to organic substance • ремоделювання хроматину • roof of mouth development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • embryonic pattern specification • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron migration • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • cartilage development • регуляція експресії генів • osteoblast development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23314	212712
Ensembl	ENSG00000119042	ENSMUSG00000038331
UniProt	Q9UPW6	Q8VI24
RefSeq (мРНК)	NM_001172509 NM_001172517 NM_015265	NM_139146 NM_001358580 NM_001358581
RefSeq (білок)	NP_001165980 NP_001165988 NP_056080	NP_631885 NP_001345509 NP_001345510
Локус (UCSC)	Хр. 2: 199.27 – 199.47 Mb	Хр. 1: 56.83 – 57.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SATB2 (англ. SATB homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 733 амінокислот, а молекулярна маса — 82 555.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERRSESPCL		RDSPDRRSGS		PDVKGPPPVK		VARLEQNGSP		MGARGRPNGA
VAKAVGGLMI		PVFCVVEQLD		GSLEYDNREE		HAEFVLVRKD		VLFSQLVETA
LLALGYSHSS		AAQAQGIIKL		GRWNPLPLSY		VTDAPDATVA		DMLQDVYHVV
TLKIQLQSCS		KLEDLPAEQW		NHATVRNALK		ELLKEMNQST		LAKECPLSQS
MISSIVNSTY		YANVSATKCQ		EFGRWYKKYK		KIKVERVERE		NLSDYCVLGQ
RPMHLPNMNQ		LASLGKTNEQ		SPHSQIHHST		PIRNQVPALQ		PIMSPGLLSP
QLSPQLVRQQ		IAMAHLINQQ		IAVSRLLAHQ		HPQAINQQFL		NHPPIPRAVK
PEPTNSSVEV		SPDIYQQVRD		ELKRASVSQA		VFARVAFNRT		QGLLSEILRK
EEDPRTASQS		LLVNLRAMQN		FLNLPEVERD		RIYQDERERS		MNPNVSMVSS
ASSSPSSSRT		PQAKTSTPTT		DLPIKVDGAN		INITAAIYDE		IQQEMKRAKV
SQALFAKVAA		NKSQGWLCEL		LRWKENPSPE		NRTLWENLCT		IRRFLNLPQH
ERDVIYEEES		RHHHSERMQH		VVQLPPEPVQ		VLHRQQSQPA		KESSPPREEA
PPPPPPTEDS		CAKKPRSRTK		ISLEALGILQ		SFIHDVGLYP		DQEAIHTLSA
QLDLPKHTII		KFFQNQRYHV		KHHGKLKEHL		GSAVDVAEYK		DEELLTESEE
NDSEEGSEEM		YKVEAEEENA		DKSKAAPAEI		DQR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dobreva G., Dambacher J., Grosschedl R. (2003). SUMO modification of a novel MAR-binding protein, SATB2, modulates immunoglobulin mu gene expression. Genes Dev. 17: 3048—3061. PMID 14701874 DOI:10.1101/gad.1153003
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 2