Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXB7
Ідентифікатори
Символи
HOXB7 , HHO.C1, HOX2, HOX2C, Hox-2.3, homeobox B7
Зовнішні ІД
OMIM : 142962 MGI: 96188 HomoloGene: 55828 GeneCards: HOXB7
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес
• multicellular organism development • embryonic skeletal system morphogenesis • myeloid cell differentiation • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 48.61 – 48.63 Mb
Хр. 11: 96.18 – 96.18 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HOXB7 (англ. Homeobox B7 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217 амінокислот , а молекулярна маса — 24 015[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSSLYYANTL FSKYPASSSV FATGAFPEQT SCAFASNPQR PGYGAGSGAS
FAASMQGLYP GGGGMAGQSA AGVYAAGYGL EPSSFNMHCA PFEQNLSGVC
PGDSAKAAGA KEQRDSDLAA ESNFRIYPWM RSSGTDRKRG RQTYTRYQTL
ELEKEFHYNR YLTRRRRIEI AHTLCLTERQ IKIWFQNRRM KWKKENKTAG
PGTTGQDRAE AEEEEEE
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Baier L.J., Hannibal M.C., Hanley E.W., Nabel G.J. (1991). Lymphoid expression and TATAA binding of a human protein containing an Antennapedia homeodomain. Blood . 78 : 1047—1055. PMID 1678287
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші