Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HEYL
Ідентифікатори
Символи
HEYL , HESR3, HEY3, HRT3, bHLHb33, hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif-like, hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif like
Зовнішні ІД
OMIM : 609034 MGI: 1860511 HomoloGene: 8494 GeneCards: HEYL
Онтологія гена
Молекулярна функція
• microsatellite binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • AF-1 domain binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific double-stranded DNA binding
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of androgen receptor signaling pathway • cellular response to BMP stimulus • glomerulus development • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • proximal tubule development • skeletal muscle cell differentiation • Сигнальний шлях Notch • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of neuron differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • outflow tract morphogenesis • atrioventricular valve morphogenesis • cardiac ventricle morphogenesis • cardiac epithelial to mesenchymal transition • mesenchymal cell development • pulmonary valve morphogenesis • epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation • ventricular septum morphogenesis • endocardial cushion morphogenesis • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription of Notch receptor target • blood vessel development • heart development • диференціація клітин • regulation of neurogenesis • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • aortic valve morphogenesis • Notch signaling involved in heart development • anterior/posterior pattern specification • circulatory system development
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 39.62 – 39.64 Mb
Хр. 4: 123.13 – 123.14 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HEYL (англ. Hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif-like ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 328 амінокислот , а молекулярна маса — 35 087[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKRPKEPSGS DGESDGPIDV GQEGQLSQMA RPLSTPSSSQ MQARKKHRGI
IEKRRRDRIN SSLSELRRLV PTAFEKQGSS KLEKAEVLQM TVDHLKMLHA
TGGTGFFDAR ALAVDFRSIG FRECLTEVIR YLGVLEGPSS RADPVRIRLL
SHLNSYAAEM EPSPTPTGPL AFPAWPWSFF HSCPGLPALS NQLAILGRVP
SPVLPGVSSP AYPIPALRTA PLRRATGIIL PARRNVLPSR GASSTRRARP
LERPATPVPV APSSRAARSS HIAPLLQSSS PTPPGPTGSA AYVAVPTPNS
SSPGPAGRPA GAMLYHSWVS EITEIGAF
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Maier M.M., Gessler M. (2000). Comparative analysis of the human and mouse Hey1 promoter: Hey genes are new Notch target genes. Biochem. Biophys. Res. Commun . 275 : 652—660. PMID 10964718 DOI :10.1006/bbrc.2000.3354
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші