Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TFAP4
Ідентифікатори
Символи
TFAP4 , AP-4, bHLHc41, transcription factor AP-4 (activating enhancer binding protein 4), transcription factor AP-4
Зовнішні ІД
OMIM : 600743 MGI: 103239 HomoloGene: 2424 GeneCards: TFAP4
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • protein dimerization activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • histone deacetylase binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • E-box binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента
• transcription repressor complex • клітинне ядро • мітохондрія
Біологічний процес
• negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • transcription, DNA-templated • negative regulation of gene expression • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator • cellular response to dexamethasone stimulus • negative regulation of DNA binding • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway • positive regulation of apoptotic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of mitotic cell cycle phase transition • GO:0034622 protein-containing complex assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 16: 4.26 – 4.27 Mb
Хр. 16: 4.36 – 4.38 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
TFAP4 (англ. Transcription factor AP-4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот , а молекулярна маса — 38 726[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEYFMVPTQK VPSLQHFRKT EKEVIGGLCS LANIPLTPET QRDQERRIRR
EIANSNERRR MQSINAGFQS LKTLIPHTDG EKLSKAAILQ QTAEYIFSLE
QEKTRLLQQN TQLKRFIQEL SGSSPKRRRA EDKDEGIGSP DIWEDEKAED
LRREMIELRQ QLDKERSVRM MLEEQVRSLE AHMYPEKLKV IAQQVQLQQQ
QEQVRLLHQE KLEREQQQLR TQLLPPPAPT HHPTVIVPAP PPPPSHHINV
VTMGPSSVIN SVSTSRQNLD TIVQAIQHIE GTQEKQELEE EQRRAVIVKP
VRSCPEAPTS DTASDSEASD SDAMDQSREE PSGDGELP
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші